Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms