Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms