Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms