Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms