Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc2Q05020 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc2Q05020 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc2Q05020 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms