Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx2Q04744 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms