Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col1a2Q01149 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms