Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms