Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms