Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx2Q00262 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms