Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VldlrP98156 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms