Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms