Protein–RNA interactions for Protein: P97797

Sirpa, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SirpaP97797 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SirpaP97797 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SirpaP97797 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SirpaP97797 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SirpaP97797 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SirpaP97797 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SirpaP97797 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SirpaP97797 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SirpaP97797 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SirpaP97797 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SirpaP97797 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SirpaP97797 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SirpaP97797 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SirpaP97797 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SirpaP97797 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms