Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
rp9P97762 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
rp9P97762 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
rp9P97762 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
rp9P97762 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
rp9P97762 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
rp9P97762 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
rp9P97762 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
rp9P97762 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
rp9P97762 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
rp9P97762 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
rp9P97762 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
rp9P97762 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
rp9P97762 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
rp9P97762 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
rp9P97762 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
rp9P97762 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
rp9P97762 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
rp9P97762 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
rp9P97762 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
rp9P97762 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
rp9P97762 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
rp9P97762 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
rp9P97762 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
rp9P97762 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
rp9P97762 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
rp9P97762 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
rp9P97762 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
rp9P97762 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
rp9P97762 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
rp9P97762 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
rp9P97762 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
rp9P97762 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
rp9P97762 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
rp9P97762 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
rp9P97762 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
rp9P97762 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
rp9P97762 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
rp9P97762 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
rp9P97762 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
rp9P97762 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
rp9P97762 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
rp9P97762 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
rp9P97762 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
rp9P97762 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
rp9P97762 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
rp9P97762 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
rp9P97762 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
rp9P97762 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
rp9P97762 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
rp9P97762 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
rp9P97762 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
rp9P97762 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
rp9P97762 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
rp9P97762 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
rp9P97762 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
rp9P97762 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
rp9P97762 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
rp9P97762 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
rp9P97762 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
rp9P97762 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
rp9P97762 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
rp9P97762 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
rp9P97762 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
rp9P97762 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
rp9P97762 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
rp9P97762 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
rp9P97762 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
rp9P97762 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
rp9P97762 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
rp9P97762 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
rp9P97762 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms