Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx1P81068 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx1P81068 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx1P81068 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms