Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Ptprn2P80560 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
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Ptprn2P80560 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Ptprn2P80560 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptprn2P80560 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptprn2P80560 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptprn2P80560 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptprn2P80560 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptprn2P80560 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptprn2P80560 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptprn2P80560 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptprn2P80560 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptprn2P80560 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptprn2P80560 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptprn2P80560 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptprn2P80560 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptprn2P80560 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptprn2P80560 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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