Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stra8P70278 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stra8P70278 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stra8P70278 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra8P70278 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra8P70278 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra8P70278 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms