Protein–RNA interactions for Protein: P68373

Tuba1c, Tubulin alpha-1C chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba1cP68373 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba1cP68373 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms