Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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