Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2nP61089 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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