Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b6P59708 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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