Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf2P58021 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms