Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox7bP56393 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms