Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms