Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbtP53395 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbtP53395 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbtP53395 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbtP53395 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbtP53395 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbtP53395 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbtP53395 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbtP53395 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbtP53395 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbtP53395 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbtP53395 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbtP53395 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbtP53395 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DbtP53395 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbtP53395 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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DbtP53395 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbtP53395 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DbtP53395 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbtP53395 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbtP53395 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbtP53395 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbtP53395 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbtP53395 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbtP53395 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DbtP53395 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbtP53395 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbtP53395 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbtP53395 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbtP53395 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbtP53395 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbtP53395 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbtP53395 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DbtP53395 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbtP53395 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms