Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClgnP52194 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClgnP52194 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClgnP52194 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClgnP52194 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms