Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SftpdP50404 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SftpdP50404 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SftpdP50404 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SftpdP50404 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SftpdP50404 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms