Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms