Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp13P33435 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp13P33435 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms