Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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