Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Saa4P31532 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Saa4P31532 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Saa4P31532 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms