Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Xrcc5P27641 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xrcc5P27641 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xrcc5P27641 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xrcc5P27641 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Xrcc5P27641 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Xrcc5P27641 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Xrcc5P27641 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Xrcc5P27641 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xrcc5P27641 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xrcc5P27641 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Xrcc5P27641 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Xrcc5P27641 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Xrcc5P27641 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Xrcc5P27641 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xrcc5P27641 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Xrcc5P27641 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Xrcc5P27641 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Xrcc5P27641 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Xrcc5P27641 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xrcc5P27641 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xrcc5P27641 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xrcc5P27641 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xrcc5P27641 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xrcc5P27641 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xrcc5P27641 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Xrcc5P27641 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Xrcc5P27641 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Xrcc5P27641 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Xrcc5P27641 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Xrcc5P27641 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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