Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms