Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms