Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ggta1P23336 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms