Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms