Protein–RNA interactions for Protein: P21460

Cst3, Cystatin-C, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cst3P21460 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cst3P21460 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms