Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VimP20152 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VimP20152 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VimP20152 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VimP20152 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VimP20152 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VimP20152 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VimP20152 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VimP20152 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VimP20152 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VimP20152 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VimP20152 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VimP20152 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VimP20152 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VimP20152 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VimP20152 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VimP20152 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VimP20152 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VimP20152 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VimP20152 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VimP20152 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VimP20152 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VimP20152 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VimP20152 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VimP20152 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VimP20152 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms