Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PcnaP17918 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnaP17918 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PcnaP17918 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PcnaP17918 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms