Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f1P17208 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms