Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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