Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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UbbP0CG49 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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UbbP0CG49 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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UbbP0CG49 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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UbbP0CG49 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UbbP0CG49 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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