Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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