Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa5P09021 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa5P09021 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms