Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NefmP08553 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NefmP08553 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NefmP08553 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NefmP08553 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NefmP08553 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NefmP08553 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NefmP08553 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NefmP08553 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NefmP08553 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NefmP08553 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NefmP08553 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NefmP08553 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NefmP08553 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NefmP08553 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NefmP08553 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NefmP08553 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefmP08553 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefmP08553 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefmP08553 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefmP08553 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefmP08553 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefmP08553 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefmP08553 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NefmP08553 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NefmP08553 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NefmP08553 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefmP08553 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefmP08553 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefmP08553 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefmP08553 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefmP08553 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefmP08553 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefmP08553 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefmP08553 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefmP08553 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefmP08553 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NefmP08553 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NefmP08553 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NefmP08553 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NefmP08553 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NefmP08553 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NefmP08553 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NefmP08553 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NefmP08553 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NefmP08553 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NefmP08553 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NefmP08553 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NefmP08553 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NefmP08553 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NefmP08553 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NefmP08553 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NefmP08553 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NefmP08553 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NefmP08553 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NefmP08553 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NefmP08553 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NefmP08553 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NefmP08553 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NefmP08553 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NefmP08553 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NefmP08553 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefmP08553 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NefmP08553 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NefmP08553 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NefmP08553 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NefmP08553 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NefmP08553 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NefmP08553 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NefmP08553 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NefmP08553 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NefmP08553 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NefmP08553 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NefmP08553 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NefmP08553 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms