Protein–RNA interactions for Protein: P01843

Ig lambda-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01843 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01843 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01843 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01843 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01843 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01843 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01843 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01843 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01843 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01843 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01843 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01843 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01843 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01843 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01843 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01843 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01843 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01843 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01843 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01843 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01843 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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