Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casp8O89110 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms