Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaskO70589 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaskO70589 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CaskO70589 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaskO70589 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaskO70589 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaskO70589 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaskO70589 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaskO70589 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaskO70589 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaskO70589 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaskO70589 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaskO70589 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaskO70589 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaskO70589 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaskO70589 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CaskO70589 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CaskO70589 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CaskO70589 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CaskO70589 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CaskO70589 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CaskO70589 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CaskO70589 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CaskO70589 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CaskO70589 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CaskO70589 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CaskO70589 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CaskO70589 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CaskO70589 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CaskO70589 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CaskO70589 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CaskO70589 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CaskO70589 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms