Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma3O70435 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma3O70435 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma3O70435 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma3O70435 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma3O70435 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma3O70435 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma3O70435 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma3O70435 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma3O70435 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma3O70435 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms