Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FiglaO55208 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FiglaO55208 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms